Z ostatních částí NAP lze vyvodit určité povinnosti pro integraci mezi jednotlivými informačními systémy. Je nutno rozlišovat, zda se jedná o vnitřní či vnější integraci a také, jaké údaje a za jakým účelem se v integraci vyměňují. Integraci informačních systémů můžeme rozdělit následovně:
Integrace uvnitř jednoho ISVS mezi více komponentami
Integrace uvnitř systémů jednoho správce (vnitřní integrace)
mezi dvěma informačními systémy veřejné správy
mezi informačním systémem a systémem spisové služby a mezi informačním systémem a jmenným rejstříkem
mezi ISVS a provozním informačním systémem
na portál za účelem zveřejnění
Integrace na systémy jiného správce (externí integrace)